以土壤二普、国土三调、全国农用地土壤污染状况详查等工作形成的相关成果为基础，统筹现有工作平台、系统等资源，坚持摸清土壤质量与完善土壤类型相结合、土壤性状普查与土壤利用调查相结合、外业调查观测与内业测试化验相结合、土壤表层采样与重点剖面采集相结合、摸清土壤障碍因素与提出改良培肥措施相结合、政府主导与专业支撑相结合的“六结合”的方式方法。建立土壤三普统一工作平台，统一技术规程，编制土壤三普统一工作底图，统一规划布设外业调查采样点位，统一筛选测试化验专业机构，构建涵盖普查全过程统一质控体系。按照“统一领导、部门协作、分级负责、各方参与”的原则组织实施。

一是加强组织领导。成立国务院第三次全国土壤普查工作领导小组及办公室，办公室设在农业农村部，负责普查工作的具体组织和协调。地方各级人民政府成立相应的普查领导小组及办公室，负责本地区普查工作的组织和实施。

二是强化技术支撑。全国和各省土壤三普办公室组织开展技术规程制定、技术培训、技术指导，成立专家指导组和技术工作组，负责重大技术疑难问题咨询、指导与技术把关等。各省（自治区、直辖市）组建省级专家指导组和专业普查队伍体系，承担本区域的外业调查和采样等工作。需要注意的是，在土壤三普培训上，除由全国各级土壤三普办委托的单位外，其他社会第三方的培训都与各地组织开展土壤三普无关。

三是强化经费保障。土壤普查经费由中央财政和地方财政按承担的工作任务配置。地方各级人民政府根据工作进度安排，统筹资金渠道经费支持土壤三普工作，纳入相应年度预算，并加强监督审计。

四是加强宣传引导。广泛宣传土壤普查重要意义，提高全社会对土壤三普工作重要性的认识。认真做好舆情引导，积极回应社会关切的热点问题，营造良好的外部环境。